Neviem či som správne pochopil problém, ale skúsim poradiť - weight paint musia mať namalované všetky kosti, inak sa nebudú navzájom ovplyvnovať. Napr. Máš armatúru - dve spojené kosti priradené na mesh( trebárs rameno, lokeť) Vyberieš kosť ramena a priradené vertexy premaluješ na červeno(bude mať najsilnejšiu váhu). To isté urob aj pre kosť loktu. Ked majú obe svoj weight paint, môžeš pre každú kosť premalovať miesta kde potrebuješ intenzitu(závislosť) kostí zmeniť. Pričom môžeš (často musíš) malovať aj na vertexy, priradené druhej kosti.
Dúfam, že som to napísal zrozumitelne, lebo som s tým mal nedávno tiež problém
BTW: defaultný envelope zatial nepoužívam vôbec, zdá sa mi nedostatočný na rigovanie